上海海事大学继续教育学院是上海海事大学下属的二级学院，下设船员培训、航海职教、函授夜大和陆上职业培训等部门。学院与上海船员培训中心，按两块牌子、一套班子方式进行运作，下设船员培训部、函授夜大部、继续教育部、航海职教部四个教学管理机构，分别负责组织各类船员参加国家海事局适任证书的考证培训和特殊培训，成人学历教育本、专科和专业证书教育，交通系统高中层次管理干部和技术干部岗位培训和继续教育以及面向上海及浦东的各类技术培训，高级船员培养项目。2015年，继续教育学院上海船员培训中心整体搬迁至浦东大道2600号海事大学港湾校区。继续教育学院的优势和特长为航运类高等教育和专业培训，上海船员培训中心的优势为提供广泛的、系统的航海专业适任和技术培训，特别是在高级船员方面。学院/中心的培训规模和质量在上海市和国家交通运输系统有一定的声誉和影响。